Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMDP57764 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GSDMDP57764 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms