Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB25P57735 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms