Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK1P57059 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK1P57059 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK1P57059 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK1P57059 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK1P57059 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK1P57059 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK1P57059 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms