Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX17P56962 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX17P56962 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX17P56962 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX17P56962 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX17P56962 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
STX17P56962 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX17P56962 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX17P56962 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms