Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX10P56693 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX10P56693 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX10P56693 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX10P56693 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX10P56693 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX10P56693 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX10P56693 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX10P56693 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX10P56693 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX10P56693 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX10P56693 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX10P56693 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX10P56693 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms