Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1P56182 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1P56182 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1P56182 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1P56182 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms