Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1LP55160 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms