Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATN1P54259 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATN1P54259 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATN1P54259 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATN1P54259 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms