Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFNA5P52803 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA5P52803 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms