Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LUMP51884 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LUMP51884 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LUMP51884 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms