Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB27AP51159 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB27AP51159 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms