Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERFP50548 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERFP50548 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERFP50548 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERFP50548 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms