Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTCFP49711 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTCFP49711 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTCFP49711 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTCFP49711 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTCFP49711 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTCFP49711 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms