Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP4P49662 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP4P49662 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP4P49662 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP4P49662 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP4P49662 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP4P49662 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms