Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLCP48506 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLCP48506 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLCP48506 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms