Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSSP48449 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSSP48449 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSSP48449 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSSP48449 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSSP48449 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSSP48449 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSSP48449 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms