Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLH1P40692 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH1P40692 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH1P40692 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH1P40692 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH1P40692 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH1P40692 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH1P40692 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH1P40692 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms