Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DSG3P32926 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DSG3P32926 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG3P32926 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG3P32926 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG3P32926 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG3P32926 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSG3P32926 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSG3P32926 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSG3P32926 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms