Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H1P32780 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms