Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC3AP31941 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms