Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSPOP30536 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPOP30536 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPOP30536 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms