Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRABP1P29762 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CRABP1P29762 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms