Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP1P28562 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms