Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA3P26006 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms