Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS6KB1P23443 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KB1P23443 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms