Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HRCP23327 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
HRCP23327 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
HRCP23327 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HRCP23327 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HRCP23327 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HRCP23327 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HRCP23327 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HRCP23327 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HRCP23327 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HRCP23327 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HRCP23327 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HRCP23327 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HRCP23327 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HRCP23327 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HRCP23327 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms