Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2B1P20020 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms