Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZKSCAN1P17029 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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