Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3L1P16619 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCL3L1P16619 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms