Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A2P16615 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms