Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFAP15692 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VEGFAP15692 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms