Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNT1P13805 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms