Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 SDL1YIL167W 633 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 TDA8YAL064C-A 381 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YAR062WYAR062W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YAR069CYAR069C 294 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SMA2YML066C 1110 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 INP1YMR204C 1263 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YBR062CYBR062C 543 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YPR172WYPR172W 603 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 NFT1YKR103W 3657 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YME2YMR302C 2553 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SRB8YCR081W 4284 nt2.51□□□□□ -2.01
MSI1P13712 ITC1YGL133W 3795 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YGR293CYGR293C 462 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RLP24YLR009W 600 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YLR202CYLR202C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 CWC24YLR323C 780 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RPL23AYBL087C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 MPP6YNR024W 561 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 MSN1YOL116W 1149 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YPL068CYPL068C 882 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 UTP15YMR093W 1542 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PUF6YDR496C 1971 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 TMA64YDR117C 1698 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 CTF13YMR094W 1437 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 NEL1YHR035W 1893 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 UBP14YBR058C 2346 nt2.5□□□□□ -2.01
MSI1P13712 KHA1YJL094C 2622 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 VMA8YEL051W 771 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 AST2YER101C 1293 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 STE18YJR086W 333 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 ATP18YML081C-A 180 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 MEI5YPL121C 669 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YBR071WYBR071W 636 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 NCS2YNL119W 1482 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PCK1YKR097W 1650 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SEC7YDR170C 6030 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SRB4YER022W 2064 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 MAL33YBR297W 1407 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 DIA2YOR080W 2199 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RPN3YER021W 1572 nt2.49□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SKO1YNL167C 1944 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 TOM70YNL121C 1854 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YNL193WYNL193W 1677 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SMC2YFR031C 3513 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RPL23BYER117W 414 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YGL159WYGL159W 1113 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 SLX9YGR081C 633 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 MRPL38YKL170W 417 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YLR297WYLR297W 390 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 COX14YML129C 213 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YNL150WYNL150W 408 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YNL203CYNL203C 612 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RCN2YOR220W 798 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RBL2YOR265W 321 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YDR338CYDR338C 2088 nt2.48□□□□□ -2.01
MSI1P13712 ILS1YBL076C 3219 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 URB2YJR041C 3525 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YLR278CYLR278C 4026 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 DBP10YDL031W 2988 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 JJJ2YJL162C 1752 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YCR090CYCR090C 549 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 HMF1YER057C 390 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YGR018CYGR018C 330 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YGR053CYGR053C 852 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YGR228WYGR228W 345 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PRS3YHL011C 963 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 APQ13YJL075C 417 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PDP3YLR455W 915 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RIM9YMR063W 720 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PDS5YMR076C 3834 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YPR050CYPR050C 414 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PIS1YPR113W 663 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 AVT2YEL064C 1443 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 RSE1YML049C 4086 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 ECM29YHL030W 5607 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 PDC2YDR081C 2778 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 YAT2YER024W 2772 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 DBF20YPR111W 1695 nt2.47□□□□□ -2.01
MSI1P13712 NDT80YHR124W 1884 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 EAP1YKL204W 1899 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 SCY1YGL083W 2415 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 SWC4YGR002C 1431 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 snR59snR59 78 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 YDL016CYDL016C 303 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 IST3YIR005W 447 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 ACF4YJR083C 930 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 YLR224WYLR224W 1110 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 COX8YLR395C 237 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 VPS20YMR077C 666 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 SWD3YBR175W 948 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 MDM1YML104C 3384 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 ARK1YNL020C 1917 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 BNA4YBL098W 1383 nt2.46□□□□□ -2.02
MSI1P13712 EXO84YBR102C 2262 nt2.45□□□□□ -2.02
MSI1P13712 VAC8YEL013W 1737 nt2.45□□□□□ -2.02
MSI1P13712 ERG11YHR007C 1593 nt2.45□□□□□ -2.02
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