Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RLBP1P12271 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms