Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODC1P11926 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODC1P11926 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODC1P11926 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ODC1P11926 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms