Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP2C9P11712 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP2C9P11712 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms