Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRFP10586 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms