Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBSLP0DN79 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBSLP0DN79 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms