Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2CP0DJJ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRGAP2CP0DJJ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms