Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB5P09067 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms