Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGPP08493 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGPP08493 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGPP08493 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MGPP08493 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms