Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF1RP07333 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF1RP07333 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms