Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAVP06756 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAVP06756 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms