Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR3DP05423 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms