Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms