Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFDP00746 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFDP00746 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFDP00746 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFDP00746 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CFDP00746 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CFDP00746 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFDP00746 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFDP00746 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFDP00746 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms