Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3O95983 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD3O95983 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD3O95983 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MBD3O95983 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD3O95983 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MBD3O95983 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MBD3O95983 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MBD3O95983 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms