Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYF2O95926 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYF2O95926 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms