Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
POLR1AO95602 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms