Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABARAPO95166 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms